Mikrobioloogilise kollektsiooni kasutusteenus, sh säilitamine ja täiendamine on vajalik teadus- ja rakendusuuringute tegemiseks.
Mitmed mikrobioloogia valdkonna analüüsid kuuluvad ka kvalitatiivsete analüüside valdkonda, seega kasutatakse kollektsiooni näidiseid ka järelevalve käigus tehtavate analüüside võrdlusmaterjalina.
METKi kollektsioon sisaldab 564 liiki baktereid, pärmseeni, hallitusseeni ja söögiseeni:
- 193 bakterikultuuri
- 45 pärmikultuuri, sh veini- kui ka õllepärmid
- 324 seenekultuuri, sh söögiseened
- 2 aktinomütseetide kultuuri
Seentest on kollektsioonis esindatud 12 erinevat söögiseent (Agaricales ehk šampinjonilaadsed), millest austerserviku (Pleurotus ostreatus) ja lõvilaka (Hericium erinaceus) mütseeli pakume ka huvilistele kevadel müügiks.
Kultuure säilitatakse vitriinkülmikutes kaldagaritel ja ka - 80 kraadi juures sügavkülmikus. Kollektsiooni säilitamiseks ja korrastamiseks tuleb iga-aastaselt teatud osa säilikuid ümber külvata. METK teeb kollektsiooni korrastamine, säilikute identifitseerimine, kvaliteedi ja elujõulisuse kontrolli ning info levitamise osas koostööd Tartu Ülikooli, Eesti Maaülikooli ja Tallinna Botaanikaaiaga. Mikroorganismide kollektsiooni säilitatakse METKi taimetervise ja mikrobioloogia laboris.
Kollektsiooni loomisest ja säilitamisest 1949-2015
EMMTUI mikrobioloogia ja agromullateaduse laboris, aastal 1949, olid esimesteks säilitatavateks kultuurideks mügarbakterid (Rhizobium).
Alates sellest ajast oli kollektsiooni säilitatud edasikülvamise meetodil. Kuna kollektsioon on oma olemuselt väärtuslik, tekkis vajadus leida efektiivsem meetod selle säilitamiseks ja sellega seoses ka kontrollimiseks. Kollektsiooni korrastamist alustati mügarbakteritest, kuna need on põllumajanduslikus mõttes kõige väärtuslikumad.
Tööd bakterkultuuridega alustati 2011. aasta jaanuaris, millesse on kogu taimetervise ja mikrobioloogia labori personal andnud oma panuse.
Rhizobium´ite tüvede molekulaarsete 16-S rRNA järjestuse põhjal FERA-s (The Food and Environment Research Agency, York, Inglismaa) tehtud analüüsitulemuste põhjal on koostatud fülogeneesipuu.
2014-2015 töötas kollektsiooniga Tallinna Tehnikaülikooli Geenitehnoloogia instituudi tudeng Veronika Timarova, kes kirjutas oma eksperimentide põhjal oma magistritöö teemal "Fusarium ja Aspergillus liikide toksilisuse hindamine". Juhendajateks: Anu Aasapõllu Molekulaardiagnostika õppetooli vanemteadur Tallinna Tehnikaülikool, Helena Lasner ja Maria Gusina Põllumajandusuuringute Keskusest.
Mikroorganismide kollektsioonile lisaks on METKi töökollektsioon bakteritest ja viirusmaterjalist, mida on erinevatest kollektsioonidest soetanud (tihti LOA-Letter of Authority alusel). METKis kasutame kollektsiooni positiivse referentsmaterjalina. Lisaks on METKis entomoloogiline kollektsioon, mis on samuti tekkinud aastatepikkuse praktika käigus.
