Taimetervise ja mikrobioloogia valdkond

METK Laboris on taimetervise ja mikrobioloogia valdkonnas võimalik määrata taimekahjustajaid ja taimehaigusi (bakterioloogilised, viroloogilised, nematoloogilised, mükoloogilised, entomoloogilised analüüsid) ning umbrohtusid.

taimetervise hinnakirjad leiad siit 

mikrobioloogia hinnakirjad leiad siit 

Kontakt:


372 523 3864 või +372 506 8201
[email protected]

Telli METKi teenuste infokiri


Lisaks teostatakse mikrobioloogilisi analüüse ja määratakse üldtoksilisust taimsetest saadustest, teraviljast, teraviljatoodetest, söödast, söödakomponentidest, kompostist ja mullast. Taimetervise ja mikrobioloogia laboris säilitatakse ka mikroorganismide kollektsiooni.

Juhendid

Kuna õigest proovi kogumisest ja pakendamisest sõltub sageli ka lõplik analüüsitulemus, on väga oluline, et taimekahjustajate laboratoorseks määramiseks laborisse saadetud proov on võetud õigesti ning seda on analüüsi läbiviimiseks piisavas koguses.

proovivõtmise juhendid

Teostatavad analüüsid

Bakterioloogilised
Kartuli, viljapuude ja maasika bakterhaigused: kartuli ringmädanik ja pruun-baktermädanik, maasika bakterpõletik ja viljapuu-bakterpõletik (vt viimase kohta lähemalt siit.)

Viroloogilised
Kartuli viirushaigused (PVA, PVY, PVX, PVM, PVS, PLRV, PMTV, TRV), kartuli värtnakujulisuse viroid (PSTVd); köögiviljade viirushaigused (PepMV, TSWV, CMV, TRV), viljapuude viirushaigused (PPV).

Entomoloogilised 
Taimedel ja taimsetes saadustes putukkahjurid ja lestad.

Mükoloogilised 
Taimedel, taimsetes saadustes, mullas või kasvusubstraadis seenhaigused (nt Phytophthora ramorum, Phytophthora kernoviae, Gibberella circinata, punavöötaud Mycosphaerella pini, pruunvöötaud Mycosphaerella dearnessii, kartulivähk Synchytrium endobioticum, Colletotrichum acutatum, Phytophthora fragariae, Plasmodiophora brassicae (nuuter, protist) jt.

Nematoloogilised
T
aimedel, mullas või kasvusubstraadis nematoodid, (nt kartuli-kiduuss, kartuli-ingerjas, harilik ingerjas, maasika-närbuss, männi-laguuss jt).


Mikrobioloogilised 
Erinevate bakterite, hallitus- ja pärmseente ja toksilisuse määramine taimsetes saadustes, söödas, kompostis ja mullas. Rakendusuuringuteks vajalike mikroorganismide kollektsiooni säilitamine ja täiendamine. Uute baktertüvede selekteerimine taimse materjali efektiivseks kasvatamiseks ja säilitamiseks.

Molekulaarbioloogilised 
Laboris on võimalik teostada erinevate taimehaiguste ja –kahjurite määramist ja kinnitamist ka kaasaegsete molekulaarbioloogiliste meetoditega (nt PCR jt).  


Taimetervise- ja mikrobioloogia labori juhendid

Üldised nõuded proovi võtmisel

Vajadusel konsulteerida enne proovi võtmist taimetervise ja mikrobioloogia labori spetsialistidega [email protected] või telefonil 5233864, 5068201.

Puhtus proovi võtmisel ja pakendamisel

  • Enne ja pärast proovi võtmist pesta ja desinfitseerida käed ja proovivõtu vahendid (käärid, nuga, pintsetid jne) (näiteks minimaalselt 70% etanooli/piiritust sisaldava vahendiga).
  • Proovide pakendamiseks tuleb kasutada puhtaid, terveid, kuivi pakendeid.
  • Kui kasutate proovi võtmisel ühekordseid kindaid, siis nad peavad olema kindlasti talgivabad (Powder free).

Kuna õigest proovi kogumisest ja pakendamisest sõltub sageli ka lõplik analüüsitulemus, on väga oluline, et taimekahjustajate laboratoorseks määramiseks laborisse saadetud proov on võetud õigesti ning seda on analüüsi läbiviimiseks piisavas koguses.

Labor ei pane diagnoosi vaid pildimaterjali põhjal

Igasugune prooviga koos laborisse saadetud pildimaterjal ning kahjustuse iseloomu ja ulatuse kirjeldus aitab kaasa õige meetodi valikule ja seeläbi võib kiirendada analüüsi läbiviimist.

Lisamaterjali võib saata otse labori kontaktile [email protected], viidates konkreetsele tellijale ja proovi kliendipoolsele tunnuskoodile.

Lõplik analüüsitulemus selgub peale proovi-spetsiifiliste laborianalüüside läbiviimist, st taimetervise ja mikrobioloogia laboratoorium ei pane diagnoosi vaid kliendi poolt saadetud pildimaterjali põhjal. 

Pakendamine

Igasuguste proovide pakendamisel sulgeda proovipakend (nt kilekott, karp, purk vmt) alati korralikult, asetada see omakorda tugevasse paberkotti ning IGA paberkoti peale kleepida või kirjutada niiskuskindla markeriga kliendipoolne proovi tunnuskood. Seejärel sulgeda kott hoolikalt teibiga.

Juhul, kui proov pakendatakse suurde  tugevasse kilekotti (terve väiksema istiku või suurema taimeosa saatmisel), tuleb see teibiga korralikult sulgeda nii, et ükski taimeosa ei ulatu kotist välja.

Kui korraga saadetakse palju proove, siis asetada kõik väiksemad proovikotid omakorda puhtasse, tugevasse kotti või karpi, et nende käitlemisel (nt postiga laborisse saatmisel) pakend ei puruneks, ükski proov ega prooviosa kotist välja ei kukuks ega lahtised proovid omavahel ega ümbritsevas keskkonnas ei saastuks.

Tühimikud karbis täita kortsutatud ajalehepaberi või muu täitematerjaliga, et vältida proovide liikumist ning viga saamist transpordi käigus.

Tellimuse vormistamine ja saatmine

Tunnuskoodi andmiseks klient nummerdab oma proovid (näiteks 1, 2, 3 jne) või paneb kirja partiide numbrid. Kliendipoolne tunnuskood märgitakse analüüsi tulemusele. 

Vormistada tellimus elektrooniliselt või paberkandjal. Tellimislehel peab olema märgitud samapalju proove kui on konkreetse pakendiga laborisse saadetud.

Proovipakend peab laborisse jõudmisel olema kahjustamata ning analüüsi tellimisleht või prooviga kaasnev kirjalik materjal ei tohi olla prooviga vahetus kokkupuutes.

Kiirproovide puhul kirjutada suurelt välispakendile märge "KIIRE".

Tuua või saata proov esimesel võimalusel laborisse. Võimaluse vältida proovide saatmist vahetult enne nädalavahetust.

Labor väljastab kliendile e-postiga analüüsiprotokolli koos analüüsitulemustega.

Labor ei väljasta kliendi proovi analüüsitulemusi kolmandale osapoolele (välja arvatud juhtudel, kui see on seadusega ette nähtud). 

Protokollis on iga proovi kohta eraldi näidatud kõikide teostatud analüüside meetodid ja tulemus, so negatiivne või positiivne, leitud kahjuri nimetus jne. Kui on märge "negatiivne" - siis antud proovis ei ole haigustekitajat tuvastatud. Kui on märge "positiivne" - siis antud proovis tuvastati haigustekitaja.

Juhul, kui proov osutub positiivseks ohtliku taimekahjustaja suhtes, edastab labor kehtivale seadusandlusele tuginedes sellekohase info ka Põllumajandus- ja Toiduametile.

Üldjuhul tuleks taimehaiguste (näiteks seen-, bakter- või viirushaigused) või nematoodide kahtluse korral arvestada järgnevaga:

  • üldjuhul ei anna täiesti surnud/kuivanud taime analüüs selget tulemust;
  • proovi võtmisel otsida eelkõige haigussümptomitega taimeosi (varred, lehed, juured, viljad);
  • erinevad taimeosad (varred/lehed, viljad, juured) tuleb pakendis üksteisest eraldada;
  • nematoodide määramiseks on vaja laborisse saata taime pesemata juuri ning u 1 kg mulda/turvast/substraati, mis tuleks pakendada eraldi pakendisse;
  • kui proov võetakse mitmelt taimelt, siis ühelt taimelt ei tohi võtta nii palju lehti või oksi, et taime elujõud ja kvaliteet kannataks (vähemalt 10 taimeosa, vähemalt 10-20 lehte);
  • rohtsetelt võrsetippudelt või puitunud oksa- ja varreosadelt tuleb proov lõigata selliselt, et kahjustusega osa kõrvale jääb mõni cm kahjustumata kudet;
  • lehtede ja okste prooviks võtmisest ei tohi taimele jääda rebimisjälgi, lõikehaavad peavad olema korrektsed;
  • mugulad, lillesibulad või muud varreteisendite partiist valida välja vähemalt 10 haigustunnustega taimeosa, nende puudumisel võtta partii kohta keskmine proov väliselt tervetest taimeosadest ning muld pakendada eraldi kotti.

Taimeosade proovi pakendamine

Proovide pakendamise üldreegel on see, et proov tuleb koguda kilekotti, taimse materjali ümber asetada niiskustimav paber/filterpaber (välja arvatud osade viirushaiguste määramisel, nt Pepino mosaiik viiruse määramine lehtedest).

Kott sulgeda korralikult ning prooviga kilekott pakendada omakorda tugevasse paberkotti.

Videojuhis (2:57 min)

Nõutavad proovide kogused taimehaiguste määramisel

Taimeosa (leht, rohtne või puitunud oksa ja- ja varreosa) mükoloogiline, bakterioloogiline või viroloogiline analüüs.

  • Taimede osad üldiselt: vähemalt 10 või enam taimeosa.
  • Erinevates haigusstaadiumites lehed, üldjuhul mitte täielikult surnud lehed: 15-20 lehte. 
  • Rohtsed võrsetipud või puitunud oksa- ja varreosad (läbimõõt 1.0-2.0 cm) - lõigatud pikkusega 10-15 cm. Proov peab olema lõigatud selliselt, et kahjustusega osa kõrvale on jäänud mõni cm kahjustumata kudet: vähemalt 10 oksa.
  • Viljapuu-bakterpõletiku (Erwinia amylovora) kahtlus - lõigatud 10-15 cm pikkused võrsetipud: 100 võrsetippu või vähemalt 30 (30-100), minimaalselt 5 (5-30) võrsetippu.
  • Viljapuu-bakterpõletiku (Erwinia amylovora) monitooring - lõigatud 10-15 cm pikkused võrsetipud: 100 võrsetippu.

    Loe täpsemalt siit.

Lillesibula, muud varreteisendi ja vilja mükoloogiline, entomoloogiline ja (või) nematoloogiline analüüs.

  • Lillesibulad või muud varreteisendid - ohtlike taimenematoodide haigustunnustega eksemplarid, nende puudumisel on partii kohta võetud keskmine proov väliselt tervetest eksemplaridest: 10 lillesibulat või muud varreteisendit.
  • Köögiviljad - ohtlike taimenematoodide haigustunnustega eksemplarid, nende puudumisel on partii kohta võetud keskmine proov väliselt tervetest eksemplaridest: 10 vilja või köögivilja.
  • Mugulad - ohtlike taimekahjustajate (sh kiduuss), kartuli-ringmädaniku ja pruun-baktermädaniku ning viirushaiguste määramiseks toodud mugulad ei tohi olla pestud: mugulaproovi suurus on 200 mugulat. Osade problemaatiliste sortide puhul võib labor eelnevalt kokkuleppeliselt kliendiga lisaks paluda saata veel kümmekond mugulat.
  • Haigustunnustega viljad: 10 vilja

Taimehaiguste (nt seen-, bakter- või viirushaigused) või nematoodide kahtluse korral arvestada järgnevaga:

  • üldjuhul ei anna surnud või täielikult kuivanud istikute analüüs selget tulemust;
  • prooviks otsida eelkõige haigussümptomitega istikuid;
  • erinevad taimeosad (varred, lehed ja juured) tuleb pakendis üksteisest eraldada. Pakendamisel tuleb eraldada juured maapealsest osast (nt lehtedega varred) ning pakkida kilekotti ja siduda kinni, et vältida mullaga määrdumist ning mulla sattumist taime lehtedele;
  • nematoodide määramiseks on vaja laborisse saata lisaks umbes 1 kg istiku kasvukoha mulda/turvast/substraati, mis tuleks pakendada eraldi pakendisse.

Videojuhis (1:52 min)

Nõutavad proovide kogused taimehaiguste määramisel

Rohttaime (näiteks maasika-, lilletaime, sibulatega taime), puittaime mükoloogiline, entomoloogiline ja (või) nematoloogiline analüüs.

  • Terve taim on üles kaevatud (mitte tõmmatud). Üldjuhul ei tohiks lehestik olla mullaga määrdunud: 5 rohttaime, sibulate ja mugulatega taimi vähemalt 10, puittaimi 3.

Mullaproovi võtmine (taimetervis) - nõutavad kogused mulla- ja turbaproovidele

Taimi kahjustavad nematoodid (nt kartuli-kiduuss, kartuli-ingerjas, harilik ingerjas, maasika-närbuss, männi-laguuss jt) on valdavalt seotud mullas asuvate taimeosadega.

Üks keskmine mullaproov koosneb võimalikult paljudest kuni 20 cm sügavuselt võetud algproovidest (võtta lusikaga põllu probleemsetest kohtadest nii, et saaks välja noppida kivid). Kogutud osaproovid tuleb kokku segada puhtas anumas. ​​​​​

Mullaproovi suurus sõltub ka põllu suurusest. Ühe hektari kohta peab võtma 400 ml mulda, mis oma korda koosneb 100st algproovist, mis on võetud iga 20 meetri tagant (vaata aljärgnev skeem).

Kui turbast soovitakse saada vaid kiduussi analüüsi, siis on piisav proovi kogus 200-250ml, kui aga soovitakse samast proovist veel teisigi analüüse, siis on proovi suuruseks 1000 ml.

Mulda või turvast pakendatakse korralikult suletud kilekotti ning seejärel paberkotti.

Korrektselt võetud keskmise mullaproovi võib võtta järgneva skeemi järgi:

Mullaproovide võtmisel tuleb vältida mulla edasikandmist ühelt põllult või tootmispinnalt teisele. Liikudes edasi järgmisele põllule või tootmispinnale tuleb jalanõud ja töövahendid puhastada mullast ja pesta veega.

Hoidlast võetud mullaproovi võtmiseks harjatakse muld mugulatelt maha ja/või pühitakse kokku põrandalt.

Videojuhis (2:13 min)

Nõutavad proovide kogused mulla- ja turbaproovidele

  • Kartuli kiduussi määramiseks mullaproovi või turbaproovi suurus on 250 ml. Juhul, kui proov on suurem, siis analüüsib labori valikuliselt 250 ml.
  • Kartulivähi määramiseks on mullaproovi või turbaproovi suurus 500 ml.

 NB! Kartuli-kiduussi ja kartulivähi määramiseks on vaja kaks eraldi proovi.

Putukkahjurite kahtluse korral arvestada järgnevaga:

  • kasutatavad pakendid peavad olema kuivad, et vältida kahjurite lagunemist;
  • võimalusel koguda kuni 10 tk erinevas arengujärgus kahjurit proovi kohta, kuna üksikud kahjurid võivad transpordi ajal kahjustuda ning sageli on neid siis raske määrata;
  • saata laborisse ka kahjustatud taimeosad (nt pahad, kaevandid, imemis- ja söömajäljed jne), mis on väärtuslik abimaterjal kahjustaja tuvastamisel;

Kõik putukate arengujärgud saata võimalusel laborisse elusana nii kiiresti kui võimalik! Proove kindlasti mitte saata vahetult enne nädalavahetust!

Videojuhis (2:05 min)

Erinevatel putukaproovidel on erinevad proovi kogumise nõuded:

  • valmikud (mardikalised, liblikalised, kärbselised, lutikalised) ja nende nukud koguda eraldi katseklaasi või purki. Võimalusel saata laborisse koos valmikutega ka nende vastseid;
  • mullas avastatud vastsed saata koos mullaga;
  • putukate vastsed ja väikesed putukad (ripstiivalised, karilised, kilptäilised, lehetäilised, lehekirbulised jne) ning lestalised saata koos kahjustatud taime osaga;
  • liimpüünisel peab olema vähemalt 5 kahjurit. Kuna püüniselt kahjuri määramine on raskendatud, otsida proovi võtmiseks taimikust ka elusaid kahjureid või kahjustatud taimeosi.

Erinevatel putukaproovidel on ka erinevad pakendamise nõuded:

  • elusate putukate transpordiks kasutada lekkimiskindlalt suletud katseklaasi, purki või nt ka uriiniproovi topsi.
  • lendavad või hüppavad kahjurid - võimalusel anuma suu täita enne kinnikorkimist tampooniks keeratud vatiga, et vältida kahjurite põgenemist anuma avamisel;
  • õrnad ja kõva koorikuga surnud putukad (liblikad, koid, põrnikad) asetada anumasse kihiti pehme paberiga;
  • mullas asetsevad vastsed saata koos mullaga kilekotti ja seejärel paberkotti pakendatult;
  • kahjur taimel: kogu taim tuleb üles kaevata (mitte tõmmata) ning jälgida, et kasvusubstraat lehestikku ei määriks. Asetada juurestiku osa koos mullaga eraldi kilekotti ja fikseerida kummiga. Kilekott suletakse ja asetatakse paberkotti;
  • väikesed potitaimed võib pakkida ka koos kompaktse mullapalli või potiga;
  • puittaimede istikuid on lihtsam pakendada lõigatuna mitmeks osaks.

Liimpüünise pakendamisel ja saatmisel ei tohi liimine pind, millega putukaid püütakse, karbi pinnaga kokku puutuda. Liimpüünis keerata rulli nii, et liimiga pool oleks sees ja kinnitada kummipaela, klambri või teibiga ning asetada karpi.

Puiduproovi võtmine - nõutavad kogused puiduproovidele

Männi-laguussi (Bursaphelenchus xylophilus) määramiseks saadetakse laborisse üks proov minimaalse kaaluga 150 grammi okaspuu puidulaaste, kooretükke ei tohi proovis esineda.

Koore analüüsimiseks tuleb see pakendada eraldi kilekotti.

Mikrobioloogilisteks analüüsideks esitatavad proovid

Proovide pakend peab olema laborisse jõudmisel kahjustamata.

Analüüsi tellimisleht või prooviga kaasnev kirjalik materjal ei tohi olla prooviga vahetus kokkupuutes.

Proovide minimaalsed kogused: teravili, teraviljatooted, söödaproovid, siloproovid, mullaproovid jne 200-500 g.

Viimati uuendatud 30.01.2026

open graph imagesearch block image